Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VN1R3Q9BXE9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms