Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP1Q9BWH6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP1Q9BWH6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP1Q9BWH6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms