Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM106CQ9BVX2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms