Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM2Q9BVW6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms