Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2Q9BVG9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2Q9BVG9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2Q9BVG9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2Q9BVG9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2Q9BVG9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2Q9BVG9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2Q9BVG9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2Q9BVG9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2Q9BVG9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2Q9BVG9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2Q9BVG9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2Q9BVG9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2Q9BVG9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTDSS2Q9BVG9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTDSS2Q9BVG9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms