Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms