Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2AFJQ9BTM1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2AFJQ9BTM1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms