Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SYT11Q9BT88 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms