Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1169.1 ms