Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms