Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms