Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGIP1Q9BQI5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGIP1Q9BQI5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms