Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF25Q9BQ70 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms