Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM4BQ9BQ04 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RBM4BQ9BQ04 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM4BQ9BQ04 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM4BQ9BQ04 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM4BQ9BQ04 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM4BQ9BQ04 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM4BQ9BQ04 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM4BQ9BQ04 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM4BQ9BQ04 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM4BQ9BQ04 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM4BQ9BQ04 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM4BQ9BQ04 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RBM4BQ9BQ04 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBM4BQ9BQ04 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms