Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAL3ST1Q99999 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GAL3ST1Q99999 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms