Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3AQ99856 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID3AQ99856 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3AQ99856 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms