Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEIS3Q99687 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MEIS3Q99687 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms