Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS8Q99627 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COPS8Q99627 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS8Q99627 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms