Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A3Q99624 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A3Q99624 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms