Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms