Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC5LQ99459 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC5LQ99459 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC5LQ99459 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC5LQ99459 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC5LQ99459 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC5LQ99459 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC5LQ99459 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDC5LQ99459 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC5LQ99459 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC5LQ99459 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC5LQ99459 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC5LQ99459 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC5LQ99459 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDC5LQ99459 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC5LQ99459 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDC5LQ99459 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDC5LQ99459 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC5LQ99459 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC5LQ99459 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC5LQ99459 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC5LQ99459 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC5LQ99459 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC5LQ99459 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC5LQ99459 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC5LQ99459 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC5LQ99459 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC5LQ99459 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDC5LQ99459 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC5LQ99459 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms