Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L3Q99457 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms