Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN18Q96SJ8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN18Q96SJ8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN18Q96SJ8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms