Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNAQ96QF7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms