Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3IPQ96QF0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3IPQ96QF0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms