Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC38A2Q96QD8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A2Q96QD8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms