Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LMTK3Q96Q04 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LMTK3Q96Q04 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms