Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGAP1Q96PV0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms