Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf49Q96NF6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C8orf49Q96NF6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf49Q96NF6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf49Q96NF6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms