Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRELID3AQ96N28 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRELID3AQ96N28 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms