Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
CCDC7Q96M83 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms