Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM227BQ96M60 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FAM227BQ96M60 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms