Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms