Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRIMPOLQ96LW4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRIMPOLQ96LW4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRIMPOLQ96LW4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRIMPOLQ96LW4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms