Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms