Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EP400Q96L91 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
EP400Q96L91 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms