Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPD52L3Q96J77 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms