Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SHDQ96IW2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHDQ96IW2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms