Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNF8Q96H20 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNF8Q96H20 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms