Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT2BQ96GJ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT2BQ96GJ1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms