Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1Q96FS4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms