Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELP4Q96EB1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ELP4Q96EB1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms