Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C18orf8Q96DM3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms