Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC39Q96DD0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms