Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC11Q96DB2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms