Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF501Q96CX3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF501Q96CX3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms