Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAF2Q96CS3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms