Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NSUN4Q96CB9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NSUN4Q96CB9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms