Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms