Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX21Q969T3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms